Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mmp13P33435 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms