Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nedd1P33215 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nedd1P33215 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nedd1P33215 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nedd1P33215 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nedd1P33215 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Nedd1P33215 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nedd1P33215 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nedd1P33215 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nedd1P33215 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nedd1P33215 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nedd1P33215 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nedd1P33215 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nedd1P33215 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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