Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa10P31310 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms