Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm10419-201ENSMUST00000100944 1671 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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