Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vcam1P29533 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms