Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RxrbP28704 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms