Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Ggta1P23336 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Ggta1P23336 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Ggta1P23336 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Ggta1P23336 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Ggta1P23336 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Ggta1P23336 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Ggta1P23336 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms