Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkchP23298 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkchP23298 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkchP23298 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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