Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Eif3aP23116 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms