Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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