Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a2P20490 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a2P20490 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms