Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfaP20033 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfaP20033 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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