Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NefhP19246 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NefhP19246 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NefhP19246 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NefhP19246 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NefhP19246 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NefhP19246 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NefhP19246 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NefhP19246 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NefhP19246 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NefhP19246 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NefhP19246 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NefhP19246 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NefhP19246 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NefhP19246 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NefhP19246 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NefhP19246 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NefhP19246 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NefhP19246 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NefhP19246 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NefhP19246 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NefhP19246 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NefhP19246 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NefhP19246 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NefhP19246 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NefhP19246 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NefhP19246 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NefhP19246 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms