Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms