Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsdP18242 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsdP18242 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsdP18242 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms