Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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