Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Vpreb2P13373 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms