Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms