Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P10404 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms