Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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LtaP09225 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LtaP09225 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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LtaP09225 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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LtaP09225 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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LtaP09225 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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LtaP09225 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LtaP09225 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtaP09225 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtaP09225 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtaP09225 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtaP09225 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtaP09225 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtaP09225 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtaP09225 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtaP09225 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtaP09225 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtaP09225 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtaP09225 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LtaP09225 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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