Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Col4a2P08122 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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