Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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