Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01734 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01734 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01734 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01734 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01734 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01734 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01734 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01734 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01734 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01734 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01734 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01734 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01734 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01734 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01734 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01734 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01734 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01734 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01734 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01734 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01734 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01734 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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