Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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CcnkO88874 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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CcnkO88874 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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CcnkO88874 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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CcnkO88874 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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