Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ComtO88587 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ComtO88587 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ComtO88587 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ComtO88587 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ComtO88587 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ComtO88587 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ComtO88587 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ComtO88587 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ComtO88587 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ComtO88587 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ComtO88587 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ComtO88587 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ComtO88587 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ComtO88587 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ComtO88587 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ComtO88587 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ComtO88587 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ComtO88587 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ComtO88587 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ComtO88587 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ComtO88587 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ComtO88587 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ComtO88587 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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ComtO88587 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ComtO88587 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ComtO88587 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ComtO88587 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ComtO88587 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ComtO88587 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ComtO88587 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ComtO88587 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ComtO88587 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ComtO88587 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ComtO88587 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ComtO88587 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms