Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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