Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clec11aO88200 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec11aO88200 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms