Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lnx1O70263 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms