Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Lgals6O54891 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Lgals6O54891 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Lgals6O54891 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Lgals6O54891 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Lgals6O54891 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Lgals6O54891 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Lgals6O54891 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Lgals6O54891 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Lgals6O54891 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Lgals6O54891 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Lgals6O54891 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Lgals6O54891 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Lgals6O54891 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Lgals6O54891 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Lgals6O54891 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Lgals6O54891 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms