Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChkaO54804 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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