Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cavin1O54724 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cavin1O54724 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cavin1O54724 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cavin1O54724 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cavin1O54724 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cavin1O54724 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cavin1O54724 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cavin1O54724 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cavin1O54724 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cavin1O54724 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cavin1O54724 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cavin1O54724 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cavin1O54724 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cavin1O54724 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cavin1O54724 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cavin1O54724 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cavin1O54724 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cavin1O54724 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cavin1O54724 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cavin1O54724 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cavin1O54724 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cavin1O54724 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cavin1O54724 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cavin1O54724 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cavin1O54724 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cavin1O54724 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cavin1O54724 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cavin1O54724 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cavin1O54724 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cavin1O54724 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cavin1O54724 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cavin1O54724 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cavin1O54724 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cavin1O54724 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cavin1O54724 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cavin1O54724 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cavin1O54724 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cavin1O54724 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms