Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cited2O35740 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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