Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ptch2O35595 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ptch2O35595 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ptch2O35595 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ptch2O35595 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptch2O35595 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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