Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Cnih1O35372 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Cnih1O35372 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Cnih1O35372 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Cnih1O35372 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Cnih1O35372 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Cnih1O35372 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Cnih1O35372 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnih1O35372 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnih1O35372 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnih1O35372 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnih1O35372 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnih1O35372 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnih1O35372 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnih1O35372 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Cnih1O35372 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih1O35372 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih1O35372 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih1O35372 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih1O35372 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cnih1O35372 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih1O35372 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih1O35372 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnih1O35372 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cnih1O35372 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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