Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Kcns1O35173 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Kcns1O35173 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Kcns1O35173 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Kcns1O35173 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Kcns1O35173 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Kcns1O35173 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Kcns1O35173 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Kcns1O35173 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Kcns1O35173 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Kcns1O35173 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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