Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms