Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3aO08665 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms