Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MttpO08601 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MttpO08601 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms