Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms