Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3542K7N6U2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3542K7N6U2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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