Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5849J3QPE5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms