Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms