Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm21900J3QP38 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm21900J3QP38 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm21900J3QP38 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm21900J3QP38 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm21900J3QP38 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm21900J3QP38 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm21900J3QP38 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm21900J3QP38 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Gm21900J3QP38 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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