Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Gm20918J3QN17 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Gm20918J3QN17 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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