Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Gm6176J3QK59 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Gm6176J3QK59 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Gm6176J3QK59 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Gm6176J3QK59 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Gm6176J3QK59 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Gm6176J3QK59 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Gm6176J3QK59 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Gm6176J3QK59 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm6176J3QK59 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm6176J3QK59 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6176J3QK59 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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