Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Gm21818J3KMS6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Gm21818J3KMS6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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Gm21818J3KMS6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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