Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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