Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm8220F6YKI2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms