Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Igkv1-99F6XWB2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms