Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rdh16f1E9Q9P8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rdh16f1E9Q9P8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rdh16f1E9Q9P8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rdh16f1E9Q9P8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rdh16f1E9Q9P8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rdh16f1E9Q9P8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Rdh16f1E9Q9P8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Rdh16f1E9Q9P8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rdh16f1E9Q9P8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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